一是国家卫生健康委员会主管的中医药管理部门，二是各省、自治区、直辖市卫生健康委员会下属的中医药管理部门，这两类机构都是经过国家批准设立的具有权威性的卫生行政部门，负责全国范围内中医药行业的管理和监督工作。

国家卫生健康委员会主管的中医药管理部门主要包括国家中医药管理局、国家中医药综合改革示范区办公室等，这些部门负责制定和发布中医药行业的政策法规，对中医药行业进行宏观指导和管理，国家卫生健康委员会还设有专门的中医药考试认证中心，负责组织和实施中医理疗师资格证的考试工作。

各省、自治区、直辖市卫生健康委员会下属的中医药管理部门则是在国家卫生健康委员会的指导下，负责本行政区域内的中医药管理工作，这些部门会根据国家卫生健康委员会的政策法规，结合本地实际情况，制定本地区的中医药管理政策和措施，这些部门也会负责本地区中医理疗师资格证的考试工作。

中医理疗师资格证的颁发程序一般包括以下几个步骤：考生需要向所在地的中医药管理部门报名参加中医理疗师资格证考试；考生在规定的时间内参加考试，并通过考试；考生将相关材料提交给所在地的中医药管理部门，由该部门审核后颁发中医理疗师资格证。

中医理疗师资格证的有效期一般为5年，期满后可以继续参加考试延期，中医理疗师还可以通过不断学习和实践，提高自己的业务水平，最终获得更高级别的中医理疗师资格证书。

中医理疗师资格证的颁发机构主要分为国家卫生健康委员会主管的中医药管理部门和各省、自治区、直辖市卫生健康委员会下属的中医药管理部门，这两类机构都是具有权威性的卫生行政部门，负责全国范围内中医药行业的管理和监督工作，考生在获得中医理疗师资格证后，可以在中医康复、养生保健等领域发挥专业技能，为广大人民群众提供优质的中医服务。