健康管理师证书发证机关是指负责管理和颁发健康管理师职业资格证书的政府部门或机构，健康管理师证书的发证机关主要有以下几个：

1、国家卫生健康委员会(原卫生部):作为中国政府部门中主管医疗卫生事务的机构，国家卫生健康委员会负责制定和实施健康政策、法规和标准，对健康管理行业进行监管，国家卫生健康委员会下设的全国卫生健康人才交流服务中心(原卫生人才网)负责健康管理师职业资格证书的发放和管理。

2、各省、自治区、直辖市卫生健康委员会：在国家卫生健康委员会的指导下，各省、自治区、直辖市卫生健康委员会负责本地区健康管理工作的组织和实施，各地卫生健康委员会下设的健康管理师培训中心或职业技能鉴定所负责健康管理师职业资格证书的培训、考试和发放。

3、大型企事业单位人力资源部门：部分大型企事业单位为了提高员工的健康水平和工作效率，会设立专门的健康管理岗位，负责组织和实施企业内部的健康管理工作，这些企业会与当地的卫生健康委员会或培训中心合作，为员工提供健康管理师职业资格证书的培训和考试服务。

4、社会培训机构：为了满足市场对健康管理师人才的需求，一些社会培训机构也会开设健康管理师培训课程，并协助学员参加培训和考试，这些培训机构通常会与卫生健康委员会或职业技能鉴定所合作，负责发放学员取得的健康管理师职业资格证书。

5、中国职业技能鉴定指导中心：中国职业技能鉴定指导中心是国家人力资源和社会保障部直属事业单位，负责全国职业技能鉴定工作的组织和指导，该中心设有健康管理师职业技能鉴定考试，考生通过考试后可以获得健康管理师职业资格证书。

健康管理师证书发证机关包括国家卫生健康委员会及其下属机构、各省、自治区、直辖市卫生健康委员会、大型企事业单位人力资源部门、社会培训机构以及中国职业技能鉴定指导中心等，考生在报名参加健康管理师培训和考试时，需要选择具有相应资质和授权的发证机关进行报名和缴费，考生在获得健康管理师职业资格证书后，还需要到发证机关进行备案登记，以便在职场上展示自己的专业素养和能力。