中医康复理疗师发证机构主要负责对从事中医康复理疗工作的人员进行资格认证，确保其具备相应的专业知识和技能，中医康复理疗师发证机构主要包括以下几个部门：

1、国家卫生健康委员会(简称国家卫健委):国家卫健委是中华人民共和国国务院组成部门，负责全国卫生健康工作的领导和管理，国家卫健委下设多个司局，其中就包括中医药管理局，负责中医药事业的发展和管理，在中医药管理局下设有中医康复科，主要负责中医康复工作的规划、政策制定和监督执行。

2、各省、自治区、直辖市卫生健康委员会：各省、自治区、直辖市卫生健康委员会是地方卫生健康工作的领导机构，负责本行政区域内的卫生健康工作，各省级卫生健康委员会下设中医药管理处，负责本省中医药事业的发展和管理，包括中医康复工作的组织和实施。

3、中医药行业协会：中医药行业协会是代表中医药行业利益的社会团体组织，负责协调、指导和监督会员单位的工作，中医药行业协会下设多个专业委员会，如中医康复专业委员会，负责中医康复工作的培训、交流和评估。

4、职业培训机构：为了提高中医康复理疗师的专业素质和技能，各级职业培训机构会开展相关课程和培训，这些机构通常由政府部门或行业协会主管，提供系统的中医康复理疗知识和技能培训。

5、企事业单位：一些企事业单位也会设立专门的中医康复理疗部门，负责本单位员工的中医康复理疗工作，这些单位通常会与职业培训机构合作，为员工提供专业的培训和实践机会。

6、个人执业诊所：随着中医康复理疗行业的不断发展，越来越多的个人执业者开始涉足这一领域，他们需要通过中医康复理疗师发证机构的认证，以便在市场上合法经营。

7、国际组织：随着中国中医药事业的国际化进程，一些国际组织也开始关注和支持中医康复理疗师的发展，世界卫生组织(WHO)等国际组织会与中国政府和相关部门合作，共同推动中医康复理疗师的培训和发展。

中医康复理疗师发证机构涉及多个部门和机构，共同推动中医康复理疗事业的发展，在这个过程中，国家卫健委、各省卫生健康委员会、中医药行业协会、职业培训机构、企事业单位以及个人执业诊所等都发挥着重要作用，通过这些部门和机构的协作和支持，不断提高中医康复理疗师的专业素质和技能，为广大患者提供更好的服务。